Três anos se passaram desde que o garoto Pelle foi picado por uma formiga no jardim de um cientista, que acabou lhe dando superpoderes e o transformando em O Garoto Formiga. Enquanto Pelle curte as férias de Verão ao lado de sua namorada Ida, eventos misteriosos começam a acontecer e um novo super-herói chega à cidade, humilhando o Garoto-Formiga, que está decidido a descobrir quem ele é e quais são seus planos. Ao mesmo tempo, um grande vilão sai da prisão e tem planos de colocar as mãos nas pesquisas de um grande laboratório local. As férias do Garoto-Formiga parecem ter acabado!