Um arqueólogo chamado Dr. Linquist leva os irmãos Lee a um antigo Dragon Dojo subterrâneo, onde eles descobrem poderosos artefatos de dragão conhecidos como Dragon Claws. Dr. Linquist também descobre um ser antigo conhecido como Shadow Khan, que está preso em uma prisão de escudo.

Ice Pick inventa um novo sistema de realidade virtual semelhante a um videogame que lhe permite explodir pessoas e objetos no mundo real. Quando ele consegue digitalizar os Double Dragons para o videogame, um jovem obcecado por videogame chamado Danny deve usar suas habilidades para ajudar os irmãos Lee a escapar da máquina de realidade virtual e recuperar as Dragon Claws.

O Shadow Master começa a usar um sistema de realidade virtual para roubar dados de computador de todo o mundo. Quando ele sequestra a namorada de Kona, que é secretamente um agente secreto da Interpol, os Dragons recorrem a um hacker de computador preso chamado Megabyte para derrotar o Shadow Master em seu próprio jogo.

O Mestre das Sombras disse à cidade quando o dia do juízo final chegará e cabe ao Dragão Duplo pará-lo.

O Shadow Master mais uma vez usa um sistema de realidade virtual, desta vez para absorver a mente das pessoas e se tornar o homem mais inteligente do mundo. Billy, Jimmy e Kona devem mais uma vez se unir a Megabyte e Sashiko para parar o Mestre das Sombras e libertar as mentes presas.

Quando o Shadow Master começa a escravizar uma cidade subterrânea de mutantes em sua fábrica, os Double Dragons decidem resgatar os trabalhadores com a ajuda de um mutante chamado Daj.

O Shadow Master rouba uma espada e espera poder libertar um espírito maligno de dentro.

A contagem regressiva trai o Mestre das Sombras após ser punido por atrapalhar uma missão. Com a ajuda de Countdown, o Shadow Khan hipnotiza Daj e faz com que ele lance as Garras do Dragão na Chama Negra, libertando Khan de sua prisão. Depois de dominar o Shadow Master e assumir o controle de seus Shadow Warriors, Khan lança um ataque ao Dragon Dojo.

Enquanto os mutantes de Undertown se erguem para serem aceitos como iguais por Metro City, o Shadow Master trama um plano para sequestrar a filha do comissário de polícia e colocar a culpa nos mutantes. Os Double Dragons não devem apenas deter a violência crescente entre Metro City e os mutantes de Undertown, mas também resgatar a filha do comissário.

O Shadow Khan revive seu antigo grupo Terror Warriors e começa a atacar Metro City. Descobrindo que suas armas e armaduras atuais são inúteis contra Khan e seus guerreiros, os dragões recorrem a um velho amigo, Kami, para criar uma nova armadura que os ajudará a parar o Shadow Khan e seus asseclas.

O Shadow Master revive uma besta antiga conhecida como Shadowmonster, que há séculos derrotou o mestre de Dao Lung, Chen Long. Para sua surpresa, Dao Lung então descobre seu mestre dormindo em uma caverna, vivo e bem. Os dragões então despertam o antigo Dragon Warrior para ajudar a lutar contra o Shadowmonster mais uma vez.

Os dragões encontram um velho inimigo na cidade subterrânea.

O Shadow Master começa a fabricar uma droga parecida com esteroide chamada RPM em sua nova fábrica subterrânea. Quando ele contamina Billy com a droga, Jimmy e Daj devem libertar Billy e ajudá-lo a quebrar seu vício.