A bordo de um balão roubado, o capitão Cyrus Harding e mais três soldados da União fogem de um campo de prisioneiros Confederado. A noite da fuga é tempestuosa e obriga o balão a ir em direção do oceano Pacífico até uma ilha onde finalmente descem. Ao explorar a ilha, acabam encontrando duas náufragas e, um grupo de perigosos animais gigantes. Em sua luta contra as feras e o ambiente são secretamente ajudados pelo Capitão Nemo, que havia ancorado o submarino Nautilus em uma gruta submersa. Os estranhos monstros são a última experiência do capitão que deseja aumentar a quantidade de alimentos para a população mundo. Após o encontro com o capitão, ficam sabendo que o submarino está avariado irremediavelmente e nesse ínterim, uma erupção vulcânica torna imperativa a sua partida antes da destruição completa da ilha.